趣味はなんですか？と聞きたい場合は、
What do you do in your spare(free)time?
How do you spend your spare(free)time?
などが自然な聞き方だと思います。
英語でhobbyとは何かのコレクションとか、日曜大工などの専門的なアクティビティを指すようです。
リンク: http://www.kaigaiseikatsu-supli.jp/knowledge/english/009/index.html
edabさんと同じですが、趣味について質問するとき、What is your hobby? や Do you have any hobbies? は、個人的にあまり聞いたことがありません。
「週末（お休みの日）は何をしますか？」What do you do on weekends? の方がよく聞きます。
77
good